Memahami betapa pentingnya waktu bagi sebuah proses pengiriman, khususnya dalam hal impor ke Indonesia, JNE menyiapkan tim yang berpengalaman puluhan tahun dalam penanganan dan penyelesaian urusan kepabeanan. JNE menawarkan jasa konsultasi tanpa memungut biaya dalam masalah kepabeanan bagi para pelanggan yang membutuhkan sebelum pengiriman. JNE menawarkan jasa penanganan penyelesaian proses import melalui Divisi Cargo. JNE berpengalaman menangani impor baik melalui pelabuhan laut maupun udara, gudang Cargo udara atas impor reguler ataupun gudang khusus bagi kiriman peka waktu. Pengalaman telah menjadikan JNE dipilih oleh berbagai institusi pemerintah dan non pemerintah untuk menangani distribusi dan kepabeanan untuk proyek-proyek bernilai bisnis tinggi.